使用工业上应用于啤酒生产。采用北京啤酒厂生产的1398细菌蛋白酶(枯草杆菌，中性蛋白酶，酶活力40000U／g)，其用量为大麦量的0．2％左右。添加细菌蛋白酶，可使大麦汁中的蛋白质分解作用加强，有利于啤酒的风味和提高泡沫非生物稳定性等。另外，本酶可用作面团改良剂、制革、制造蛋白水解物等。用途降低面团筋力，提高面团的可塑性及延伸性，保持清晰美观的印花图案。特别适用于饼干生产，使饼干更容易成型和压花，成品更松化且降低破碎率。应用1、中性蛋白酶是一种无毒、的蛋白质，可应用于动植物蛋白的水解，AN%高，水解度高，风味佳,生产高级调味品和食品营养强化剂的HAP和HVP。

多功能酶

21世纪发现有些酶分子存在多种催化活性，例如大肠杆菌DNA聚合酶I是一条分子质量为109kDa的多肽链，具有催化DNA链的合成、3’-5’核酸外切酶和5’-3’核酸外切酶的活性，用蛋白水解酶轻度水解得两个肽段，一个含5’-3’核酸外切酶活性，另一个含另两种酶的活性，表明大肠杆菌DNA聚合酶分子中含多个活性中心。哺乳动物的脂肪酸合成酶由两条多肽链组成，每一条多肽链均含脂肪酸合成所需的七种酶的催化活性。这种酶分子中存在多种催化活性部位的酶称为多功能酶（multifunctional enzyme）或串联酶（tandem enzyme）。多功能酶在分子结构上比多酶复合体更具有优越性，因为相关的化学反应在一个酶分子上进行，比多酶复合体更有效，这也是生物进化的结果。