快速内切酶EcoRV
REF: MD043
5'...G A T A T C...3'
3'...C T A T A G...5'
同裂酶:Eco32I
注:同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
建议反应条件
1× Reaction缓冲液;
37℃温育;
参照“DNA 快速酶切流程”配制反应体系。
失活条件:80℃ 温育 20 min。
产品组成
组分 / 规格
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MD043-200Rxns
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Storage
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快速内切酶EcoRV
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200 μl
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-20℃
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10× ReactionBuffer
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1 ml
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-20℃
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10× ReactionColor Buffer
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1 ml
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-20℃
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产品说明
快速内切酶是一系列经过基因工程重组、能够在 5~15 分钟内精确完成 DNA 切割的限制性内切酶,适用于质粒DNA、PCR 产物或基因组 DNA 等的快速酶切。快速内切酶 快速内切酶具有如下特点:5~15 分钟内即可完成酶切;共用一种酶切 Buffer,大大简化酶切反应体系;良好的酶活冗余度,轻松应对底物过量或困难模板酶切。此外,伊势久去磷酸化、连接试剂在 Reaction酶切 Buffer 中具有 100% 活性,支持一管化反应,提升“酶切—修饰—连接”的体验。
使用方法
1. DNA 快速酶切流程
①冰上按照下表配制反应体系:
质粒DNA
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PCR 产物
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基因组DNA
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ddH2O
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15μl
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16μl
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30μl
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10× ReactionBuffer 或 10× ReactionColor Buffer
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2μl
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3 μla
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5μl
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底物 DNA
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2 μl(up to 1 μg)
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10 μl(~0.2 μg)
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10 μl(5 μg)
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快速内切酶 EcoRV
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1μl
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1μl
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5μl
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Total
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20μl
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30μl
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50μl
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a. 本体系适用于经过纯化的PCR 产物酶切。未纯化的PCR 产物具备一定的离子强度,10× ReactionBuffer 加入量可适当减少至2μl。但由于DNA 聚合酶同时具有外切酶活性,会影响酶切产物,因此如下一步需进行克隆等操作,建议酶切前对PCR 产物进行纯化。
② 轻柔吸打或轻弹管壁以混匀(切勿涡旋),然后瞬时离心以收集挂壁液滴;
③ 37℃温育 15 min(质粒),或 15~30 min(PCR 产物),或 30~60 min(基因组 DNA);
④ 80℃温育 20 min 即可使酶失活,停止反应(可选)。
2. 双酶切或多酶切
① 每种快速内切酶的用量为 1 μl,并根据需要适当扩大反应体系;
② 所有快速内切酶的体积总和不得超过总反应体系的 1/10;
③ 如果所用的几种快速内切酶的最适反应温度不同,应先以最适温度低的酶开始酶切,再添加最适温度较高的酶,在其最适反应温度下进行酶切反应。
3. 适用于质粒的扩大反应体系
DNA
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1 μg
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2 μg
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3 μg
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4 μg
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5 μg
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快速内切酶 EcoRV
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1μl
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2μl
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3μl
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4μl
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5μl
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10× ReactionBuffer 或 10× ReactionColor Buffer
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2μl
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2μl
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3μl
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4μl
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5μl
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Total
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20μl
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20μl
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30μl
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40μl
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50μl
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注:如果总反应体系大于 20 μl,应适当增加温育时间,尽量使用水浴、金属浴或沙浴。
质量控制
质控项目
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质控标准
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功能活性检测
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最适反应温度下,在 20 μl反应体系中,1 μl快速内切酶 EcoRV 能够在 15 min内完全消化 1 μgλDNA 。
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星号活性测试
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最适反应温度下,将1 μl快速内切酶 EcoRV 与1 μgλDNA 共同温育 3 h,未检测到其他核酸酶污染或星号活性引起的底物非特异性降解,延时酶切可能出现星号活性
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酶切—连接—再酶切检测
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最适反应温度下,使用 1 μl快速内切酶 EcoRV 消化底物,回收酶切产物。在 22 ℃下使用适量 Fast T4 DNA Ligase 可以将酶切产物重新连接。将连接产物再次回收后,使用相同的内切酶可以重新切开连接产物。
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非特异性内切酶活性检测
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最适反应温度下,使用 1 μl快速内切酶EcoRV 与 1 μg超螺旋质粒 DNA 共同温育 4 h,使用琼脂糖凝胶电泳检测,质粒 DNA 仍然处于超螺旋状态。
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蓝白斑检测
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将含有单一lacZα 基因的载体以 1 μlEcoRV消化,重新连接后转化入大肠杆菌感受态细胞,涂布在含有对应抗生素、 IPTG 和 X-gal 的 LB 培养基平板上。连接正确的产物会生长出蓝色菌落,而连接错误(即 DNA 末端切口不完整)的产物将得到白色菌落。对于 Reaction系列限制酶而言,白色菌落比例应小于1%。
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不同 DNA 中的酶切位点数量
λDNA
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ΦX174
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pBR322
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pUC57
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pUC18/19
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SV40
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M13mp18/19
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Adeno2
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21
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0
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1
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1
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0
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1
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0
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9
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甲基化修饰影响
Dam
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Dcm
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CpG
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EcoKI
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EcoBI
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无影响
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无影响
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无影响
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无影响
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序列可能重叠
剪切可能受影响
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在不同反应缓冲液中的活性
BIOISCO
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Thermo Scientific
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NEB
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Takara
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ReactionBuffer
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FastDigest Buffer
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CutSmart? Buffer
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QuickCut? Buffer
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活性
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100%
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100%
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100%
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100%
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注:活性数据来自 BIOISCO 限制酶标准反应体系下的检测。