丙氨酸有α-丙氨酸和β-丙氨酸两种同分异构体

α-丙氨酸亦称2－氨基丙酸。200℃以上升华，随加热速度不同约在264～296℃之间分解。是组成蛋白质的一种成分。在营养学中属人体非的氨基酸。多从发酵法和天然产物中提取。

β-丙氨酸亦称3－氨基丙酸，无色晶体。熔点198℃（分解），溶于水，微溶于乙醇，不溶于乙醚。用于合成泛酸和电镀，也用于微生物学和生物化学等的研究上，可由丝胶、明胶、玉米朊等蛋白质水解并精制而成，也可用化学方法合成。

由于氨基酸在同一pH环境中，各类氨基酸的带电状态不同，即它们具有不同的等电点（PI），这是电泳法和色谱法分离氨基酸的原理。