亚麻籽胶由酸性多糖和中性多糖组成，以酸性多糖为主，酸性多糖与中性多糖的摩尔比例为2∶1。酸性多糖由L-鼠李糖、L-岩藻糖、L-半乳糖和D-半乳糖醛酸组成，其摩尔比为2.6∶1.0∶1.4∶1.7。主链是1，2-连接的α-L-吡喃鼠李糖和1，4-连接的D-吡喃半乳糖醛酸残基，侧链是岩藻糖和半乳糖残基。基本上所有的D-半乳糖醛酸基都在主链上，所有的岩藻糖基和大约半数的L-半乳糖基存在于非还原性末端。中性多糖主要由L-阿拉伯糖、D-木糖、D-半乳糖组成，其摩尔比为3.5∶6.2∶1.0。中性多糖为高度支化的阿拉伯木聚糖，以1，4-β-D-木糖为主链，端基含有大量的吡喃阿拉伯糖单位，阿拉伯糖和半乳糖侧链连接在2和/或3位上。