沸腾干燥机的工作原理是空气在高压离心通风机的吸送下，经亚高效空气过滤器过滤，进入空气热交换器加热至设定温度，然后通过气体分布板形成无数高速气流束冲出物料，气束问所形成的负压卷吸物料，使之成为沸腾状。此状态下热空气与物料广泛地接触，增强了传热过程，因而在较短的时间内促使物料中的水份蒸发、分离。湿气流透过捕集袋由风机排出，被捕集袋截留在沸腾器内的物料则为干燥产品。