氧化性剂与非氧化性剂药效时间不同。氧化性剂具有灭藻速度快、杀生效果的广谱性高、处理费用低、对环境污染相对影响较小、微生物不易产生抗药性的优点。不足之处是受到水中的有机物和具有还原性物质的影响较大，药剂时间短，受水中的PH值影响也较大，同时，分散渗透和剥离效果差等。非氧化性灭藻剂的杀生作用有一定的长久性，对沉积物或黏泥有渗透、剥离作用，受硫化氢、氨等还原物质的影响较小，受水中PH值影响较小。但处理费用相对氧化性灭藻剂较高，容易引起环境污染，水中的微生物易产生抗药。

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