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显微镜构造很复杂,种类很多,但基本结构是由机械和光学两大部分构成,现分述如下：

　　１、机械部分：
　　它是为光学部分服务的部件,包括以下九部分：
　　(1)、镜座：显微镜最下面呈马蹄形或园形的部分,起稳定和支持镜身作用.
　　(2)、镜柱：从镜座向上直立的短柱.上连镜臂,下连镜座,可以支持镜臂和载物台.
　　(3)、镜臂：弯曲成马蹄形的部分,便于手持,下端与镜柱相连接的地方有一个倾斜关节,可使镜臂倾斜,便于观察.
　　(4)、载物台：自镜臂下端向前伸出,放置标本用的平台,其中央有一个园孔,叫通光孔.台上有一移动器（老式的左右各有一个压片夹）,用以固定和移动标本.
　　(5)、镜筒：和镜臂上方连接的园筒部分.有的显微镜镜筒内有一抽管,可适当抽长,一般长度是１６０－１７０毫米.镜筒上端装有目镜,下端有一个可转动的园盘,叫物镜转换器（或叫物镜旋转盘,固着在镜筒下端,分两层,上层固着不动,下层可自由转动.转换器上有2～4个圆孔,用来安装不同倍数的低倍或高倍物镜）.作用是保护成像的光路与亮度.
　　(6)、调节器（也叫调节螺旋）：为镜壁上两种可转动的螺旋,一大一小,能使镜筒上下移动,调节焦距.大的叫粗准焦螺旋,位于镜臂的上方,可以转动,以使镜筒能上下移动,从而调节焦距,升降镜筒较快,用于低倍镜对焦；小的叫细准焦螺旋,位于镜臂的下方,它的移动范围较粗准焦螺旋小,升降镜筒较慢,可以细调焦距.
　　(7)、倾斜关节：镜柱和镜臂交界处有一个能活动的关节.它可以使显微镜在一定的范围内后倾（一般倾斜不得超过45°）便于观察.但是在使用临时封片观察时,禁止使用倾斜关节,尤其是装片内含酸性试剂时严禁使用,以免污损镜体.
　　(8)、载物台：从镜臂向前方伸出的金属平台.呈方形或圆形,是放置玻片标本的地方.其中央具有通光孔,在通光孔的左右有一个弹性的金属压片夹,用来压住载玻片.较高级的显微镜,在载物台上常具有推进器,它包括夹片夹和推进螺旋,除夹住切片外,还可使切片在载物台上移动.
　　２、光学部分：由目镜、物镜、反光镜、聚光器等四部件组成.
　　(1)、目镜：装于镜筒上方,由两组透镜构成,接目镜的作用是把接物镜所形成的倒立实像再放大成为一个虚像.接目镜上刻有５×,８×,１０×,１５×,２５×等符号,表示放大倍数.我们所观察到的标本的物像,其放大倍数是接物镜和接目镜放大倍数的乘积.如接物镜是１０×,接目镜是８×,其物像的放大倍数是１０×８＝８０倍.
　　在接目镜内两个透镜间的光栏上可装一根剪短的毛发,做为指针,用以指示要观察的材料.
　　(2)、物镜：装在镜筒下端物镜转换器的孔中,一般的显微镜有２～４个接物镜镜头,每个镜头都是由一系列的复式透镜组成的,其上也有放大倍数记号,有４×,１０×,４０×及１００×.４×及１０×接物镜是低倍镜,４０×是高倍镜,１００×是油镜.低倍镜常用于搜索观察对象及观察标本全貌,高倍镜则用于观察标本某部分或较细微的结构,油镜则常用于观察微生物或动植物更细微的结构.
　　(3)、聚光器（集光器）：位于载物台（通光孔）下方,由两块或数块镜组成,它能将反光镜反射来的光线集中以射入接物镜和接目镜,有的聚光器可升降,便于调光,集光器下有一可伸缩的园形光圈,叫虹彩光圈,可调集光器口径的大小和照射面,以调节光线强弱（有的显微镜只有遮光极而无集光器）.光线过强时,可缩小虹彩光圈.
　　(4)、反光镜：是显微镜观察时获得光源的装置,位于显微镜镜座中央,一面为平面镜,一面为凹面镜.转动反光镜,可使外面光线通过集光器照射到标本上.使用时,光线强用平面镜,光线弱用凹面镜.