主要用作汽油添加剂，具有优良的抗爆性，提高辛烷值，亦可裂解制得异丁烯。它与汽油的混溶性好，吸水少，对环境无污染，能改善用作分析溶剂、萃取剂，在色谱中尤其是高压液相色谱中用作脱剂，与一些极性溶剂如水、甲醇、乙醇等形成共沸物。甲基叔丁基醚还有轻度麻醉作用。