哺乳动物产生的内源性消化碳水化合物的酶（主要是唾液淀粉酶、胰淀粉酶）对碳水化合物的消化主要作用于 α-1，4 糖昔键，而对其它类型的糖昔键不能分解或分解能力较弱。 壳寡糖是由N-乙酞-D-葡萄糖胺以β-1，4 糖昔键结合而成的多糖，不能被哺乳动物胃酸和消化酶降解。但是人体中应用的壳聚糖如手术缝合线、 营养保健品及其它可吸收型医用植入材料等均是通过人体血清中所含的溶菌酶降解后被人体吸收。 由于壳寡糖水溶性大于 99%， 也有研究发现高脱乙酞度的壳寡糖对于打开细胞间连接效果最显著，可通过动物肠道上皮细胞直接被吸收，据报道被人体吸收率可达到99.88%。因此，它比几丁质和壳聚糖具有更优越的生物活性。

(1)壳聚糖胶体化：将壳聚糖溶于酸溶液,得到胶体壳聚糖,加热；(2)酶解：向胶体壳聚糖中加入复合酶A,升温搅拌后加入复合酶B,恒温搅拌,再加入壳聚糖酶,继续搅拌得到壳聚糖酶解液；(3)分离：将壳聚糖酶解液经离心、膜浓缩后,即得壳寡糖