制冷系统是冻干机的最重要的组成部分，被称为“冻干机的心脏”。其制冷系统主要由以下部件组成：压缩机,制冷剂,油分离器，水冷凝器，干燥过滤器，中间冷却器，视液镜，电磁阀，手阀(顶盖阀)，膨胀阀，蒸发器(板式交换器，后箱冷凝盘管)，汽液分离器，回气过滤器，压力表，压力控制继电器， CPCE (能量调节器)，安全阀，制冷管道等