凝胶过滤——依赖于大分子的大小和形状。

吸附层析——依赖于被分离化合物与凝胶之间的氢键数量和质量。

分配层析——依赖于被分离化合物在流动相（溶剂）和固定相（凝胶）之间的分配，这主要由样品的极性和溶剂的极性决定的。