在日常生活、生产和科研等方面石英砂有着重要的用途，但有时也会对人体造成危害。

某些硅物质对人体有害,如石棉。石棉是一种纤维状的硅质矿物。人长期吸入，会引致肺部组织受破坏，这些极微细的石棉纤维会沉积在肺气泡内，引致肺部组织逐步纤维化，继而影响肺部气体交换的功能。

由于石棉纤维非肉眼所能看到，一般人对它的传播，都不能作出预防。暴露于石棉的危险性，并没有一个安全界限。基本上，各类石棉均会致癌。尚未有任何药物、外科手术或放射治疗法，可以医治与石棉有关的病症。

另外，石棉亦会引致肺癌、胸膜间皮瘤及胸膜良性病变。患上石棉沉著病的人后期可能并发支气管炎及因肺部广泛纤维化并发肺原性心脏病，导致心脏衰竭而死亡。

石英砂的粉尘极细，比表面积达到100m2/g以上可以悬浮在空气中，如果人长期吸入含有石英砂的粉尘，就会患硅肺病（因硅旧称为矽，硅肺旧称为矽肺）。